隨後，
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，兩岸民航主管部門便就M503航路進行多次溝通與說明；其中最大成果即陸方航空器將採向西偏航的運行措施。按陸方目前公布的路線圖來看，
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，M503航路距海峽中線4.2浬，
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，倘若在此基礎上再偏航4浬，
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，屆時陸方航空器距海峽中線足有8.2浬安全距離，
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，大幅降低台灣國安疑慮。此外，
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，大陸國台辦也數度表明，
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，兩岸早已建立航空安全聯繫機制，
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，兩岸空管部門通報機制運作良好，即便遭遇不可抗力的緊急狀況，將按上述規畫向西偏航外，也會即刻與台灣空管部門保持密切溝通，在技術上做好完備預案和應急處置。上海台研所常務副所長倪永杰則稱，面對M503航路議題，應該回歸飛航安全專業考量，台灣民眾心理不該過於脆弱，應拿掉內心的「柏林圍牆」。大陸社科院台研所所長周志懷也認為，馬英九政府不應被民粹綁架，進退失據。，