台灣與日本簽漁業協議受到研究兩岸問題的日本專家矢吹晉、岡田充肯定。兩位學者認為總統馬英九提出的「東海和平倡議」對解決釣魚台問題，
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，提供了1個客觀、務實的啟示。
橫濱市立大學名譽教授矢吹晉接受中央社專訪時表示，
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，日台漁協是劃時代的，
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，因為屬民間協議，
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，所以不觸及主權問題，
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，漁權問題獲得解決。
他表示，
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，看過馬英九總統當年在美國哈佛大學寫的博士論文，頗具客觀性。去年馬總統提出的東海和平倡議，內容與當年的論文相符，也才有今年4月10日台日漁協的簽署。
他觀察指出，中國大陸在思考釣魚台問題的人，不少人認為台日之間擱置主權、共享資源的方式，是解決問題的最好對策。
日本「共同通信社」客座論說委員、櫻美林大學講師岡田充受訪時表示，台日漁業協議談判了17年終於簽成，主要有兩個原因。
一是，日本首相安倍晉三很不願看到台灣與中國大陸在這議題上聯手合作，日本被說是具有離間兩岸的意圖，這點無法否認。其次是，2008年馬總統就職後，兩岸關係大幅改善，否則中國大陸會干擾，對台、日施壓。
岡田表示，台、日對於釣魚台都各主張擁有主權，台日漁協不碰觸主權，但是釣魚台海域半徑12浬，雙方漁船不進入，這是默契。2000年，中國大陸與日本之間的漁業談判也是擱置釣魚台主權才達成協議。
岡田也贊同東海和平倡議「主權不能分割，但資源可共享」的精神。他認為台日漁協就是這個倡議的具體實現。
他說，馬總統去年9月還提出「3組雙邊」會談構想，也就是台日、台灣與中國大陸、中國大陸與日本的會談，台日漁協可說是第1次的台日會談，達成第1階段目標。
有關釣魚台主權，矢吹表示，他看過蔣介石日記及相關史料，了解在1971年，當時的中華民國總統蔣介石主張擁有釣魚台主權，看法與日本對立。後來美國決定，在釣魚台列嶼主權問題上保持中立，但要求日本與當事國協商解決。
岡田說，去年8月，香港保釣人士登上釣魚台，之後日本地方議員登島，緊張局勢。後來馬總統提出東海和平倡議。
他認為，日本將釣魚台島嶼國有化的決定，變成很大的政治、外交問題，這有些愚蠢，而東海和平倡議對於要理性、客觀思考釣魚台問題，帶來了啟示。
他表示，雖然馬總統說釣魚台海域是百年來台灣漁民傳統捕撈的漁場，但他認為這500年來，日本、沖繩、台灣、中國大陸沿海漁民在這片海域可自由捕撈，如果基於民生觀點，主權問題並非是那麼大的問題，開始有爭議只是這40年來的事。1020430
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